মেটাজিনমিক্সঃ পরিবেশে প্রাপ্ত অনুজীব প্রফালিং এর মলিকুলার টুল

কোন স্যাম্পল থেকে প্রাপ্ত সকল নিউক্লিওটাইড সিকুয়েন্সের স্ট্রাকচার এবং ফাংশন স্টাডি করাকে মেটাজিনমিক্স বলে। যেমন কোন জীবের মল থেকে প্রাপ্ত  ডিএনএ স্টাডি করে সেখানে বিদ্যমান অনুজীবের পরিচিতি অর্থাৎ মলে থাকা সকল ব্যাক্টেরিয়া বা ভাইরাসের পরিচয় শনাক্ত করা যায়  মেটাজিনমিক্স পদ্ধতির মাধ্যমে। 

যদি মাটিতে থাকা অণুজীব সম্পর্কে স্টাডি করা হয়, তাহলে প্রথমে অল্প পরিমাণ মাটি ল্যাবেটরিতে নিয়ে তা থেকে ডিএনএ আলাদা করা হয়। প্রাপ্ত ডিএনএ গুলো  এনজিএস টেকনোলজির মাধ্যমে সিকুয়েন্স বের করা হয়। এ পর্যায়ে বায়োইনফরমাটিক্স অ্যানালাইসিস করে  অণুজীব এর পরিচয় শনাক্ত করা হয়।  

বায়োমেডিকেল ফিল্ডে বর্তমানে গাট মাইক্রোবায়োম নিয়ে অনেক গবেষণা হচ্ছে। গাট তথা পাকস্থলী ও নাড়িভুঁড়িতে যে সকল ব্যাক্টেরিয়া বসবাস করা তারা কীভাবে আমাদের শরীরবৃত্তীয় কার্যকলাপ প্রভাবিত করছে তা মেটাজিনমিক্স পদ্ধতির মাধ্যমে জানা যায়। 


Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

PCR কী? কেনো? কীভাবে?

Image
পিসিআর (PCR, polymerase chain reaction) একটি মলিকুলার পদ্ধতি যেখানে একটি ডিএনএ খণ্ডের অসংখ্য অনুলিপি তৈরি করা হয়। পিসিআর  বর্তমানে     মলিকুলার বায়োলজির আবিছেদ্য  একটি  অংশ। ১৯৮৩ সালে আমেরিকার প্রাণ  রসায়নবিদ ক্যারি মুলিস উক্ত পদ্ধতিটি প্রণয়ন করেন। যার ফলশ্রুতিতে ১৯৯৩ সালে তিনি রসায়নে নোবেল পুরস্কার অর্জন করেন। জীব দেহে যেভাবে ডিএনএ অনুলিপি তৈরি হয় অনেকটা সেভাবেই পিসিআর মেশিনের ভিতরে ডিএনএ খন্ডাংশের অনুলিপি তৈরি হয়। পিসিআর মেশিন মূলত একটি তাপীয় যন্ত্র যেখানে নির্দিষ্ট সময় অন্তর বিক্রিয়া অনুযায়ী তাপমাত্রা ওঠা- নামা করে। প্রথমে পিসিআর টিউবে জিনোমিক ডিএনএ বা টেমপ্লেট ডিএনএ , ২ টি প্রাইমার ( ফরওয়ার্ড ও রিভার্স ) এবং এর সাথে dNTPs ( ডিএনএ এর বেজ সমূহ তথাঃ A,T,G,C), ট্যাক পলিমারেজ , ও MgCl2   নির্দিষ্ট অনুপাতে নেয়া হয়। তবে বর্তমানে মাস্টার মিক্স নামে একটি সলিউশন ব্যবহৃত হয় যেখানে   dNTPs, ট্যাক পলিমারেজ , ও MgCl2 এর আদর্শ অনুপাত বজায় থাকে। ...
Read more

সাপের বিষদাঁত কেমন হয়?

Image
সাপ তার শিকারকে গিলে খায়। তাহলে দাঁত দিয়ে এরা কী করে?  উত্তর হচ্ছে  দাঁত দিয়ে এরা শিকার ধরে। এছাড়া বিষধর সাপ বিষদাঁত দিয়ে শিকারকে কাবু করে বা আত্মরক্ষার্থে এদের ব্যবহার করে। সুতরাং সাপে দুই ধরনের দাঁত দেখা যায়।  ১। সাধারণ দাঁত ২। বিষদাঁত  বিষদাঁত শুধু বিষধর সাপে পাওয়া যায়।  সাপের বিষদাঁত প্রধানত ২ ধরনের।  © earth.com  ১.Front Fang বা সম্মুখ বিষদাঁতঃ অধিকাংশ বিষাক্ত সাপের সম্মুখ বিষদাঁত থাকে। এদেরকে দুই ভাগে বিভক্ত করা হয়েছে।  ক)Solenoglyphous সাপঃ     এদের বিষদাঁত অনেক বড়ো এবং সাধারণ অবস্থায়  পিছনে বাঁকানো থাকে।      উদাহরণঃ Vipers ( Russell’s viper , Pit viper ) খ)Proteroglyphous সাপঃ     এদের বিষদাঁত তুলনামূলক ছোট ও সোজা থাকে।     উদাহরণঃ Elapedes(cobra),mamba ২. Rear Fang বা পশ্চাৎ বিষদাঁতঃ     Opisthoglyphous সাপদের এই দাঁত গুলো থাকে।      উদাহরণঃColubrid ( Red necked keelback )      rear fang বিশিষ্ট সাপের ক্ষেত্রে বিষদাঁত মুখের  পিছনে   ব...
Read more

iDNA এবং বন্যপ্রাণী পর্যবেক্ষণ

Image
বন্যপ্রাণী সংরক্ষণের জন্য একটি বন ভূমিতে বন্যপ্রাণীর উপস্থিতি এবং এদের জনসংখ্যা জানাটা জরুরি। এর উপর ভিত্তি করে পরবর্তী পদক্ষেপ নেয়া হয়। বন্যপ্রাণী পর্যবেক্ষণের জন্য সরাসরি পর্যবেক্ষণ যেমন বন্যপ্রাণীটিকে দেখা, বা এর ডাক শোনা, বা পায়ের ছাপ এবং মলমূত্র ইত্যাদি দেখে এদের শনাক্ত করা হয়। এর পাশাপাশি বন-জঙ্গলে ক্যামেরা বসিয়ে আরো বিশদভাবে বন্যপ্রাণী পর্যবেক্ষণ করা যায়। এ পদ্ধতিকে ক্যামেরা ট্রাপিং বলে । তবে ক্যামেরা ট্রাপিং তুলনামূলকভাবে ব্যয়বহুল এবং বেশ চ্যালেঞ্জিং। বর্তমানে তুলনামূলক কম খরচে iDNA পদ্ধতিকে কাজে লাগিয়ে বিভিন্ন দেশে বন্যপ্রাণী পর্যবেক্ষণ করা হচ্ছে। iDNA (invertebrate-derived DNA) এমন একটি মলিকুলার টেকনিক যেখানে অমেরুদণ্ডী প্রাণী থেকে মেরুদন্ড বিশিষ্ট প্রাণীর ডিএনএ আলাদা করে তাদের পরিচয় শনাক্ত করা হয়। iDNA পদ্ধতি একটি ইকোসিস্টেমে একটি জীব অন্য জীবের উপর বিভিন্ন ভাবে নির্ভরশীল। অনেক অমেরুদণ্ডী প্রাণী আছে যারা তাদের খাবারের জন্য মেরুদন্ড বিশিষ্ট প্রাণীর উপর নির্ভর করে। যেমন জোঁক মেরুদণ্ড বিশিষ্ট প্রাণীর রক্ত খেয়ে বেঁচে থাকে। তেমনিভাবে বংশ বিস্তারের জন্য স্ত্রী মশাকে রক্ত পান করতে ...
Read more